Esta pregunta no es sencilla de responder . Como  opción es un derecho y por eso ha sido regulada en muchos países del mundo donde actualmente se la aplica con éxito, USA sobre todo, UK, Italia, etc. En Argentina no está prohibida pero tampoco regulada, por ello hay que basar nuestra elección en las leyes supremas de la Constitución y Declaración de los derechos humanos entre otros. Es una RESPONSABILIDAD de los padres, entender bien el aspecto legal antes de tomar esta decisión para  SABER cómo sortear cualquier inconveniente que por desconocimiento o directamente abuso de las autoridades, podrían tener. Para más información puedes leer esta entrada con un resumen del aspecto legal .

Las denuncias y citaciones son factibles, puede pasarte. Pero para que te quiten a tus hijos, deberías estar cometiendo un delito y  no hay ley que prohíba educar en el hogar.

Para que no te digan cosas que no son y para defender como corresponde esta opción, DEBES lamentablemente capacitarte, necesitas saber todas estas leyes y regulaciones al dedillo:
Constitución Nacional
Declaración de los derechos humanos
Declaración de los derechos de los niños, niñas y adolescentes (Ley n° Ley Nº 23.849)
Código Civil (viejo y nuevo)
Convención sobre los derechos del niño
Ley Nº 23.849 (aprueba la Convención pero con observancias)
Ley de Educación Nacional (Nº 26.206)
Reglamento interno de las escuelas públicas
Reglamento interno de las escuelas privadas
Constituciones provinciales
Reglamentos internos de escuelas provinciales
Reglamentos locales
Decretos

Y por supuesto mantenerte siempre al tanto de las actualizaciones constantes de estas leyes y reglamentos.

A nadie y en ningún lado, simplemente infórmate bien de todo, lee mucho y una vez que te decidas vas al colegio y les planteas tu decisión.

Otras familias habiendo elegido una escuela a distancia, solicitan PASE aunque algunas escuelas no quieren darlo fácilmente .  Tampoco garantiza que no haya que dar explicaciones.

Al hablar con al escuela, ciertamente no vas a pedirles permiso ni a buscar que te palmeen la espalda y te deseen suerte en la vida con una sonrisa, vas a informar la elección que por derecho natural y primario has tomado.

En este sentido se recomienda, además, acompañarse de una carta dirigida a las autoridades escolares explicando su decisión de forma clara y puntual, en lo posible nombrando los artículos en los que se basan para su decisión. Aquí  cuentas con dos Modelos de carta para descargar

La carta debería presentarse con copia y pedir que se la selle y firme como recibida.

También se  recomienda pedir copia de cada acta que se redacte en las reuniones con las autoridades escolares donde conste fecha, firma, sello y una redacción clara de lo hablado.